Доктор Субраманьян занимается трансплантологией с 2007 года.

За период работы в качестве ассистента, а потом и оперирующего хирурга, он принял участие в более 700 операциях по пересадке печени от разных типов доноров и почти в 2000 трансплантаций почки.

С 2013 по 2015 год Наванетхан Субраманьян входил в состав мультидисциплинарной команды специалистов, которая выполнила самое большое количество трансплантаций печени от живого донора в Индии. Также трансплантолог с группой своих коллег проводил операции в различных медицинских центрах за рубежом (Пакистан, Бангладеш и Казахстан).

В настоящее время Наванетхан Субраманьян работает в отделении трансплантологии клиники Манипал в Бангалоре.